然而，神秘组织并没有就此罢休。他们的首领亲自驾驶着一艘巨型旗舰，冲向联军舰队。这艘旗舰周身环绕着强大的黑暗能量，如同一头愤怒的巨兽，所到之处，联军战舰纷纷被击退。

林悦决定亲自迎战神秘组织首领。她驾驶着旗舰，向着神秘组织首领的旗舰冲去。双方的旗舰在宇宙中激烈交锋，能量光束和爆炸的火光将周围的空间照亮。

在战斗中，林悦发现神秘组织首领的旗舰虽然强大，但存在一个能量供应的弱点。只要攻击这个弱点，就能削弱旗舰的战斗力。

“锁定旗舰的能量供应核心，全力攻击！”林悦带领舰队集中火力，对神秘组织首领旗舰的能量供应核心发动攻击。经过一番激烈的战斗，旗舰的能量供应核心终于被摧毁。

神秘组织首领的旗舰失去能量供应，陷入瘫痪。神秘组织的舰队见大势已去，纷纷开始撤退。林悦没有给他们喘息的机会，带领舰队乘胜追击，将神秘组织的残余势力彻底赶出了遗迹周边。

解决了眼前的危机后，林悦并没有放松警惕。她带领科研团队深入研究遗迹的异常波动，试图找到彻底稳定遗迹能量的方法。经过无数次的试验和分析，他们终于发现了一种特殊的能量频率，可以与遗迹的能量产生共鸣，从而稳定遗迹的能量波动。

林悦带领舰队在遗迹周边部署了一系列能量发射装置，发射出特殊的能量频率。随着能量频率的注入，遗迹的能量波动逐渐稳定下来，表面的符文也恢复了正常的闪烁节奏。

这场关乎宇宙存亡的危机终于得到了解决，但林悦知道，宇宙的和平依然脆弱。神秘组织虽然遭受重创，但他们很可能还会卷土重来。

回到联军总部后，林悦将此次事件的详细情况汇报给了高层。经过商讨，联军决定进一步加强宇宙防御体系的建设，加大对宇宙中潜在威胁的监测和研究力度。

林悦也因此成为了宇宙和平的传奇守护者，她的故事在宇宙间传颂。但林悦并没有沉醉在荣耀之中，她深知，只要宇宙中还有黑暗存在，她的使命就永远不会结束。

在接下来的日子里，林悦继续带领着舰队，在宇宙中巡逻和探索。她不断提升自己和舰队的实力，时刻准备着迎接新的挑战。因为她知道，守护宇宙和平的道路永无止境，而她，将永远是宇宙和平最坚定的扞卫者 。